Филиппинская фондовая биржа впервые появилась в 1993 году, но ее история длится гораздо дольше. Биржа была объединением Манильской фондовой биржи и Фондовой биржи Макати, в результате чего была создана единая биржа на Флиппинах. Слияние также стало символом для страны, которая пережила свою долю политических разногласий, что нация может действовать в едином направлении.
Фондовая биржа Манилы была основана 8 августа 1927 года пятью американскими бизнесменами. Это было в здании Insular Life на Плаза Сервантес, Бинондо. Основатели W.P.G. Эллиот, У. Эрик Литтл, Гордон У. Маккей, Джон Дж. Рассел и Фрэнк У. Уэйкфилд заявили, что им нужна фондовая биржа, которая служила бы обществу, соблюдала этические стандарты и поддерживала хорошие методы ведения бизнеса. Они также утверждали, что торговля акциями будет стимулировать экономику Филиппин. Фондовая биржа Манилы переехала в Пасиг в 1992 году.
Младшая фондовая биржа Макати была основана 27 мая 1963 года. У нее тоже было пять членов-основателей:Мигель Кампос, Бернар Габерман, Аристео Лат, Эдуардо Ортигас и Эрменегильдо Б. Рейес. Поскольку на Филиппинах уже была действующая фондовая биржа, возникла оппозиция второй. Биржа, которая находилась в Insular Life Building в Макати, не начала работать до 16 ноября 1965 года. В 1971 году она переехала в собственное здание на авеню Айяла в Макати.
Хотя на Филиппинах было две фондовые биржи, обе они торговали одними и теми же акциями. Они дублировали усилия, но у них была разная политика, разные члены и разные цены на акции. Вскоре стало очевидно, что стране нужна только одна фондовая биржа.
Президент Филиппин Фидель Рамос возглавил усилия по объединению двух бирж в одну. Филиппинская фондовая биржа была основана 14 июля 1992 года, а к 23 декабря биржи Макати и Манила согласились стать ее частью.
Первый совет управляющих Филиппинской фондовой биржи был избран 20 марта 1993 года. Они были президентом биржи и 14 брокерами-членами. Эдуардо де лос Ангелос был первым президентом Филиппинской фондовой биржи, а Эдуардо К. Лим - первым председателем правления. Буквально через год Комиссия по ценным бумагам и биржам предоставила фондовой бирже лицензию на деятельность в качестве биржи ценных бумаг. Одновременно были аннулированы лицензии на биржи Манилы и Макати. Филиппинская фондовая биржа находится в филиппинском центре фондовой биржи, Ортигас-центре, Пасиг-Сити и в PSE Plaza, Ayala Avenue, Макати-Сити. Филиппинская фондовая биржа улучшила свою цель - стать первоклассной биржей. В 1995 году она стала членом Ассоциации национальных номерных агентств. В 1998 году Комиссия по ценным бумагам и биржам сделала Филиппинскую фондовую биржу саморегулируемой организацией, что позволяет ей создавать свои собственные правила и налагать штрафы на членов.